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IR-EPI序列实际上是在SE-EPI序列前加了一个180°翻转脉冲而已，180°脉冲后的其余过程就是SE-EPI。这个180°脉冲对图像的对比度起决定性作用。采用短TI值，可形成脂肪抑制的SE-EPI序列T2加权像；采用较长的TI值，可以使图像中游离水的信号被选择性地抑制，产生脑脊液呈低信号的T2加权像，这与FLAIR序列有许多相近之处。
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