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家畜选种方法之一。通过表型所估测的基因型而进行选择。质量性状的基因型可根据表型直接判断，也可通过测交或系谱分析的方法判断基因型，然后再进行选择；数量性状的基因型一般都利用数量遗传学的原理和方法，根据本身或亲属的表型值来估测种畜的育种值，根据育种值的大小进行选择。基因型选择可取得较好的效果，但计算方法比较复杂，而且所用资料必须准确可靠。
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