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又叫抗原不连续变异，系指抗原发生质变的变异而言。在微生物中病毒的抗原最易发生此种变异，表现为病毒核酸片段分子组成发生根本的变化，改变原有的抗原性，形成新的亚型。人类甲型流感病毒素形成新的亚型，人群对此亚型无免疫性，故易发生大流行。
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