特殊配合力specific combining ability,SCA

某一杂交组合F₁的实际值与根据双亲一般配合力估测的F₁预期值的偏差。在不考虑误差的前提下，计算公式为：

实际上必须采用双列杂交等设计的试验进行分析。试验设计方法不同，分析的公式也不同。由基因的显性效应、上位性效应及基因和环境的互作效应综合决定。选择一般配合力和特殊配合力都高的优异杂交组合，F₁代可以直接用于杂种优势。

特殊配合力

指一个自交系或品种与若干材料杂交后，其中某一组合表现出比其他所有组合的经济性状值突出高的现象。在杂种优势的利用上尤为重要。