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不同种属细菌基因组DNA具有特定的DNA序列，应用PCR技术仅需极微量(5～10个细菌)的DNA作为模板即可对细菌引起的疾病进行基因诊断，这一技术为临床许多细菌性疾病的防治和预后评价提供了更为有效的手段。如痢疾的基因诊断*，霍乱弧菌CT操纵子的PCR检测*等。
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